പെപ്റ്റൈഡ് കസ്റ്റം സിന്തസിസിൽ പെപ്റ്റൈഡ് ബോണ്ട് രൂപീകരണത്തിന്റെ തത്വം എങ്ങനെയാണ്?

ഉപരിതലത്തിൽ, പെപ്റ്റൈഡ് ബോണ്ടുകളുടെ രൂപീകരണം, ഡൈപെപ്റ്റൈഡുകൾ നൽകുന്നത്, ഒരു ലളിതമായ രാസപ്രക്രിയയാണ്.നിർജ്ജലീകരണം സംഭവിക്കുമ്പോൾ രണ്ട് അമിനോ ആസിഡ് ഘടകങ്ങളും ഒരു പെപ്റ്റൈഡ് ബോണ്ട്, ഒരു അമൈഡ് ബോണ്ട് എന്നിവയാൽ ബന്ധപ്പെട്ടിരിക്കുന്നു എന്നാണ് ഇതിനർത്ഥം.

നേരിയ പ്രതികരണ സാഹചര്യങ്ങളിൽ ഒരു അമിനോ ആസിഡിനെ സജീവമാക്കുന്നതാണ് പെപ്റ്റൈഡ് ബോണ്ട് രൂപീകരണം.(A) കാർബോക്‌സിൽ മൊയ്‌റ്റി, രണ്ടാമത്തെ അമിനോ ആസിഡ് (ബി) ന്യൂക്ലിയോഫിലിക് ആക്‌റ്റിവേറ്റഡ് കാർബോക്‌സിൽ മൊയ്‌റ്റി പിന്നീട് ഡിപെപ്റ്റൈഡ് (എബി) രൂപപ്പെടുന്നു."കാർബോക്‌സിൽ ഘടകം (എ) പരിരക്ഷിച്ചില്ലെങ്കിൽ, പെപ്റ്റൈഡ് ബോണ്ടിന്റെ രൂപീകരണം നിയന്ത്രിക്കാനാവില്ല."ലീനിയർ, സൈക്ലിക് പെപ്റ്റൈഡുകൾ പോലുള്ള ഉപോൽപ്പന്നങ്ങൾ ടാർഗെറ്റ് സംയുക്തങ്ങളായ എബിയുമായി കലർന്നേക്കാം.അതിനാൽ, പെപ്റ്റൈഡ് ബോണ്ട് രൂപീകരണത്തിൽ ഉൾപ്പെടാത്ത എല്ലാ ഫങ്ഷണൽ ഗ്രൂപ്പുകളും പെപ്റ്റൈഡ് സിന്തസിസ് സമയത്ത് താൽക്കാലികമായി റിവേഴ്‌സിബിൾ രീതിയിൽ സംരക്ഷിക്കപ്പെടണം.

അതിനാൽ, പെപ്റ്റൈഡ് സിന്തസിസ് - ഓരോ പെപ്റ്റൈഡ് ബോണ്ടിന്റെയും രൂപീകരണം - സമാഹരണത്തിന്റെ മൂന്ന് ഘട്ടങ്ങൾ ഉൾപ്പെടുന്നു.

സംരക്ഷണം ആവശ്യമുള്ള ചില അമിനോ ആസിഡുകൾ തയ്യാറാക്കുകയാണ് ആദ്യപടി, അമിനോ ആസിഡുകളുടെ zwitterionic ഘടന നിലവിലില്ല.

പെപ്റ്റൈഡ് ബോണ്ടുകൾ രൂപീകരിക്കുന്നതിനുള്ള രണ്ട്-ഘട്ട പ്രതികരണമാണ് രണ്ടാമത്തെ ഘട്ടം, അതിൽ N- സംരക്ഷിത അമിനോ ആസിഡിന്റെ കാർബോക്‌സിൽ ഗ്രൂപ്പ് ആദ്യം സജീവമായ ഇന്റർമീഡിയറ്റിലേക്ക് സജീവമാക്കുകയും തുടർന്ന് പെപ്റ്റൈഡ് ബോണ്ട് രൂപപ്പെടുകയും ചെയ്യുന്നു.ഈ കപ്പിൾഡ് പ്രതികരണം ഒരു-ഘട്ട പ്രതികരണമായോ അല്ലെങ്കിൽ രണ്ട് തുടർച്ചയായ പ്രതികരണങ്ങളായോ സംഭവിക്കാം.

മൂന്നാമത്തെ ഘട്ടം സെലക്ടീവ് നീക്കം അല്ലെങ്കിൽ സംരക്ഷിത അടിത്തറയുടെ പൂർണ്ണമായ നീക്കം ആണ്.എല്ലാ പെപ്റ്റൈഡ് ശൃംഖലകളും കൂട്ടിച്ചേർത്തതിനുശേഷം മാത്രമേ എല്ലാ നീക്കം ചെയ്യലും സംഭവിക്കുകയുള്ളൂവെങ്കിലും, പെപ്റ്റൈഡ് സിന്തസിസ് തുടരുന്നതിന് സംരക്ഷിത ഗ്രൂപ്പുകളുടെ തിരഞ്ഞെടുത്ത നീക്കം ആവശ്യമാണ്.

10 അമിനോ ആസിഡുകളിൽ (Ser, Thr, Tyr, Asp, Glu, Lys, Arg, His, Sec, Cys) സൈഡ് ചെയിൻ ഫങ്ഷണൽ ഗ്രൂപ്പുകൾ അടങ്ങിയിരിക്കുന്നു, അവയ്ക്ക് സെലക്ടീവ് സംരക്ഷണം ആവശ്യമാണ്, ഇത് പെപ്റ്റൈഡ് സിന്തസിസ് കൂടുതൽ സങ്കീർണ്ണമാക്കുന്നു.സെലക്റ്റിവിറ്റിക്ക് വ്യത്യസ്ത ആവശ്യകതകൾ ഉള്ളതിനാൽ താൽക്കാലികവും അർദ്ധ-സ്ഥിരവുമായ സംരക്ഷണ അടിത്തറകൾ വേർതിരിക്കേണ്ടതാണ്.അമിനോ ആസിഡ് അല്ലെങ്കിൽ കാർബോക്‌സിൽ ഫങ്ഷണൽ ഗ്രൂപ്പുകളുടെ താൽക്കാലിക സംരക്ഷണം പ്രതിഫലിപ്പിക്കുന്നതിന് അടുത്ത ഘട്ടത്തിൽ താൽക്കാലിക സംരക്ഷണ ഗ്രൂപ്പുകൾ ഉപയോഗിക്കുന്നു.അർദ്ധ-സ്ഥിരമായ സംരക്ഷിത ഗ്രൂപ്പുകൾ ഇതിനകം രൂപപ്പെട്ട പെപ്റ്റൈഡ് ബോണ്ടുകളിലോ അമിനോ ആസിഡ് സൈഡ് ചെയിനുകളിലോ ഇടപെടാതെ നീക്കംചെയ്യുന്നു, ചിലപ്പോൾ സിന്തസിസ് സമയത്ത്.

"ആദർശപരമായി, കാർബോക്‌സിൽ ഘടകത്തിന്റെ സജീവമാക്കലും തുടർന്നുള്ള പെപ്റ്റൈഡ് ബോണ്ടുകളുടെ രൂപീകരണവും (കപ്ലിംഗ് പ്രതികരണങ്ങൾ) റേസ്മിക് അല്ലെങ്കിൽ ഉപ-ഉൽപ്പന്ന രൂപീകരണം കൂടാതെ ദ്രുതഗതിയിലുള്ളതായിരിക്കണം, കൂടാതെ ഉയർന്ന വിളവ് നേടുന്നതിന് മോളാർ റിയാക്ടന്റുകൾ പ്രയോഗിക്കുകയും വേണം."നിർഭാഗ്യവശാൽ, കെമിക്കൽ കപ്ലിംഗ് രീതികളൊന്നും ഈ ആവശ്യകതകൾ നിറവേറ്റുന്നില്ല, കൂടാതെ കുറച്ച് പ്രായോഗിക സമന്വയത്തിന് അനുയോജ്യമാണ്.

പെപ്റ്റൈഡ് സിന്തസിസ് സമയത്ത്, വിവിധ പ്രതിപ്രവർത്തനങ്ങളിൽ ഉൾപ്പെടുന്ന ഫങ്ഷണൽ ഗ്രൂപ്പുകൾ സാധാരണയായി മാനുവൽ സെന്ററുമായി ബന്ധപ്പെട്ടിരിക്കുന്നു, ഗ്ലൈസിൻ മാത്രമാണ് അപവാദം, കൂടാതെ ഭ്രമണത്തിന് സാധ്യതയുള്ള അപകടസാധ്യതയുണ്ട്.

പെപ്റ്റൈഡ് സിന്തസിസ് സൈക്കിളിലെ അവസാന ഘട്ടം എല്ലാ സംരക്ഷണ ഗ്രൂപ്പുകളുടെയും നീക്കം ആണ്.ഡിപെപ്റ്റൈഡ് സിന്തസിസിൽ സംരക്ഷണം പൂർണ്ണമായി നീക്കം ചെയ്യുന്നതിനുള്ള ആവശ്യകതയ്‌ക്ക് പുറമേ പെപ്റ്റൈഡ് ചെയിൻ വിപുലീകരണത്തിന് സംരക്ഷിത ഗ്രൂപ്പുകളുടെ തിരഞ്ഞെടുത്ത നീക്കം പ്രധാനമാണ്.സിന്തറ്റിക് തന്ത്രങ്ങൾ ശ്രദ്ധാപൂർവ്വം ആസൂത്രണം ചെയ്യണം.തന്ത്രപരമായ തിരഞ്ഞെടുപ്പിനെ ആശ്രയിച്ച്, N-ന് α-അമിനോ അല്ലെങ്കിൽ കാർബോക്‌സിൽ സംരക്ഷിത ഗ്രൂപ്പുകളെ തിരഞ്ഞെടുത്ത് നീക്കം ചെയ്യാൻ കഴിയും."തന്ത്രം" എന്ന പദം വ്യക്തിഗത അമിനോ ആസിഡുകളുടെ ഘനീഭവിക്കുന്ന പ്രതിപ്രവർത്തനങ്ങളുടെ ക്രമത്തെ സൂചിപ്പിക്കുന്നു.പൊതുവേ, ക്രമാനുഗതമായ സംശ്ലേഷണവും ശകലങ്ങളുടെ കാൻസൻസേഷനും തമ്മിൽ വ്യത്യാസമുണ്ട്.പെപ്റ്റൈഡ് സിന്തസിസ് ("പരമ്പരാഗത സിന്തസിസ്" എന്നും അറിയപ്പെടുന്നു) ലായനിയിൽ നടക്കുന്നു.മിക്ക കേസുകളിലും, പെപ്റ്റൈഡ് ശൃംഖലയുടെ ക്രമേണ നീളം കൂട്ടുന്നത് പെപ്റ്റൈഡ് ചെയിൻ ഉപയോഗിച്ച് ചെറിയ ശകലങ്ങൾ സമന്വയിപ്പിക്കുന്നതിലൂടെ മാത്രമേ സമന്വയിപ്പിക്കാൻ കഴിയൂ.ദൈർഘ്യമേറിയ പെപ്റ്റൈഡുകൾ സമന്വയിപ്പിക്കുന്നതിന്, ടാർഗെറ്റ് തന്മാത്രകളെ ഉചിതമായ ശകലങ്ങളായി വിഭജിക്കുകയും സി ടെർമിനസിലെ വ്യത്യാസത്തിന്റെ അളവ് കുറയ്ക്കാൻ കഴിയുമെന്ന് നിർണ്ണയിക്കുകയും വേണം.വ്യക്തിഗത ശകലങ്ങൾ ക്രമേണ കൂട്ടിച്ചേർത്ത ശേഷം, ടാർഗെറ്റ് സംയുക്തം കൂട്ടിച്ചേർക്കപ്പെടും.പെപ്റ്റൈഡ് സിന്തസിസിന്റെ തന്ത്രത്തിൽ ഏറ്റവും മികച്ചതും ഉചിതവുമായ സംരക്ഷിത ശകലത്തിന്റെ തിരഞ്ഞെടുപ്പ് ഉൾപ്പെടുന്നു, കൂടാതെ പെപ്റ്റൈഡ് സിന്തസിസിന്റെ തന്ത്രത്തിൽ ഏറ്റവും അനുയോജ്യമായ സംരക്ഷിത ബേസുകളുടെ തിരഞ്ഞെടുപ്പും ശകല സംയോജനത്തിന്റെ മികച്ച രീതിയും ഉൾപ്പെടുന്നു.