പെപ്റ്റൈഡ് ബോണ്ടുകൾ വഴി ഒന്നിലധികം അമിനോ ആസിഡുകൾ ബന്ധിപ്പിച്ച് രൂപപ്പെടുന്ന സംയുക്തങ്ങളുടെ ഒരു വിഭാഗമാണ് പെപ്റ്റൈഡുകൾ.ജീവജാലങ്ങളിൽ അവ സർവ്വവ്യാപിയാണ്.ഇതുവരെ, ജീവജാലങ്ങളിൽ പതിനായിരക്കണക്കിന് പെപ്റ്റൈഡുകൾ കണ്ടെത്തിയിട്ടുണ്ട്.വിവിധ സിസ്റ്റങ്ങൾ, അവയവങ്ങൾ, ടിഷ്യൂകൾ, കോശങ്ങൾ എന്നിവയുടെ പ്രവർത്തനപരമായ പ്രവർത്തനങ്ങൾ നിയന്ത്രിക്കുന്നതിലും ജീവിത പ്രവർത്തനങ്ങളിലും പെപ്റ്റൈഡുകൾ ഒരു പ്രധാന പങ്ക് വഹിക്കുന്നു, അവ പലപ്പോഴും പ്രവർത്തന വിശകലനം, ആന്റിബോഡി ഗവേഷണം, മയക്കുമരുന്ന് വികസനം, മറ്റ് മേഖലകൾ എന്നിവയിൽ ഉപയോഗിക്കുന്നു.ബയോടെക്നോളജിയുടെയും പെപ്റ്റൈഡ് സിന്തസിസ് സാങ്കേതികവിദ്യയുടെയും വികാസത്തോടെ, ക്ലിനിക്കിൽ കൂടുതൽ കൂടുതൽ പെപ്റ്റൈഡ് മരുന്നുകൾ വികസിപ്പിക്കുകയും പ്രയോഗിക്കുകയും ചെയ്തു.
വൈവിധ്യമാർന്ന പെപ്റ്റൈഡ് മോഡിഫിക്കേഷനുകൾ ഉണ്ട്, അവയെ പോസ്റ്റ് മോഡിഫിക്കേഷൻ, പ്രോസസ് മോഡിഫിക്കേഷൻ എന്നിങ്ങനെ വിഭജിക്കാം (ഉപയോഗിച്ച അമിനോ ആസിഡ് മോഡിഫിക്കേഷൻ ഉപയോഗിച്ച്), എൻ-ടെർമിനൽ മോഡിഫിക്കേഷൻ, സി-ടെർമിനൽ മോഡിഫിക്കേഷൻ, സൈഡ് ചെയിൻ മോഡിഫിക്കേഷൻ, അമിനോ ആസിഡ് പരിഷ്ക്കരണം, അസ്ഥികൂടം പരിഷ്ക്കരണം, മുതലായവ, പരിഷ്ക്കരണ സൈറ്റിനെ ആശ്രയിച്ച് (ചിത്രം 1).പെപ്റ്റൈഡ് ശൃംഖലകളുടെ പ്രധാന ശൃംഖലയുടെ ഘടനയോ സൈഡ് ചെയിൻ ഗ്രൂപ്പുകളോ മാറ്റുന്നതിനുള്ള ഒരു പ്രധാന മാർഗമെന്ന നിലയിൽ, പെപ്റ്റൈഡ് പരിഷ്ക്കരണത്തിന് പെപ്റ്റൈഡ് സംയുക്തങ്ങളുടെ ഭൗതികവും രാസപരവുമായ ഗുണങ്ങളെ ഫലപ്രദമായി മാറ്റാനും ജലത്തിന്റെ ലയനം വർദ്ധിപ്പിക്കാനും വിവോയിലെ പ്രവർത്തന സമയം വർദ്ധിപ്പിക്കാനും അവയുടെ ജൈവിക വിതരണത്തിൽ മാറ്റം വരുത്താനും രോഗപ്രതിരോധ ശേഷി ഇല്ലാതാക്കാനും കഴിയും. , വിഷലിപ്തമായ പാർശ്വഫലങ്ങൾ കുറയ്ക്കുക തുടങ്ങിയവ. ഈ പേപ്പറിൽ, നിരവധി പ്രധാന പെപ്റ്റൈഡ് പരിഷ്കരണ തന്ത്രങ്ങളും അവയുടെ സവിശേഷതകളും പരിചയപ്പെടുത്തുന്നു.
1. സൈക്ലൈസേഷൻ
സൈക്ലിക് പെപ്റ്റൈഡുകൾക്ക് ബയോമെഡിസിനിൽ ധാരാളം പ്രയോഗങ്ങളുണ്ട്, കൂടാതെ ജൈവിക പ്രവർത്തനമുള്ള പല പ്രകൃതിദത്ത പെപ്റ്റൈഡുകളും സൈക്ലിക് പെപ്റ്റൈഡുകളാണ്.ചാക്രിക പെപ്റ്റൈഡുകൾ ലീനിയർ പെപ്റ്റൈഡുകളേക്കാൾ കർക്കശമായതിനാൽ, അവ ദഹനവ്യവസ്ഥയെ അങ്ങേയറ്റം പ്രതിരോധിക്കും, ദഹനനാളത്തിൽ നിലനിൽക്കാനും ടാർഗെറ്റ് റിസപ്റ്ററുകളോട് ശക്തമായ അടുപ്പം പ്രകടിപ്പിക്കാനും കഴിയും.സൈക്ലിക് പെപ്റ്റൈഡുകളെ സമന്വയിപ്പിക്കുന്നതിനുള്ള ഏറ്റവും നേരിട്ടുള്ള മാർഗമാണ് സൈക്ലൈസേഷൻ, പ്രത്യേകിച്ച് വലിയ ഘടനാപരമായ അസ്ഥികൂടമുള്ള പെപ്റ്റൈഡുകൾക്ക്.സൈക്ലൈസേഷൻ മോഡ് അനുസരിച്ച്, അതിനെ സൈഡ് ചെയിൻ-സൈഡ് ചെയിൻ തരം, ടെർമിനൽ - സൈഡ് ചെയിൻ തരം, ടെർമിനൽ - ടെർമിനൽ തരം (അവസാനം മുതൽ അവസാനം വരെ തരം) എന്നിങ്ങനെ തിരിക്കാം.
(1) സൈഡ്ചെയിൻ-ടു-സൈഡ്ചെയിൻ
സൈഡ്-ചെയിൻ മുതൽ സൈഡ്-ചെയിൻ സൈക്ലൈസേഷന്റെ ഏറ്റവും സാധാരണമായ തരം സിസ്റ്റൈൻ അവശിഷ്ടങ്ങൾക്കിടയിൽ ഡൈസൾഫൈഡ് ബ്രിഡ്ജിംഗ് ആണ്.ഈ സൈക്ലൈസേഷൻ അവതരിപ്പിക്കുന്നത് ഒരു ജോടി സിസ്റ്റൈൻ അവശിഷ്ടങ്ങൾ ഡിപ്രൊട്ടക്റ്റ് ചെയ്യുകയും തുടർന്ന് ഓക്സിഡൈസ് ചെയ്ത് ഡൈസൾഫൈഡ് ബോണ്ടുകൾ രൂപപ്പെടുകയും ചെയ്യുന്നു.സൾഫൈഡ്രൈൽ സംരക്ഷണ ഗ്രൂപ്പുകൾ തിരഞ്ഞെടുത്ത് നീക്കം ചെയ്യുന്നതിലൂടെ പോളിസൈക്ലിക് സിന്തസിസ് നേടാനാകും.ഒരു പോസ്റ്റ്-ഡിസോസിയേഷൻ ലായകത്തിലോ അല്ലെങ്കിൽ ഒരു പ്രീ-ഡിസോസിയേഷൻ റെസിനിലോ സൈക്ലൈസേഷൻ നടത്താം.റെസിനുകളിലെ സൈക്ലൈസേഷൻ സോൾവെന്റ് സൈക്ലൈസേഷനേക്കാൾ ഫലപ്രദമല്ല, കാരണം റെസിനുകളിലെ പെപ്റ്റൈഡുകൾ പെട്ടെന്ന് സൈക്ലിഫൈഡ് കോൺഫോർമേഷനുകൾ ഉണ്ടാക്കുന്നില്ല.മറ്റൊരു തരം സൈഡ് ചെയിൻ - സൈഡ് ചെയിൻ സൈക്ലൈസേഷൻ എന്നത് ഒരു അസ്പാർട്ടിക് ആസിഡ് അല്ലെങ്കിൽ ഗ്ലൂട്ടാമിക് ആസിഡ് അവശിഷ്ടങ്ങൾക്കും ബേസ് അമിനോ ആസിഡിനും ഇടയിൽ ഒരു അമൈഡ് ഘടനയുടെ രൂപവത്കരണമാണ്, ഇതിന് സൈഡ് ചെയിൻ പ്രൊട്ടക്ഷൻ ഗ്രൂപ്പിനെ പോളിപെപ്റ്റൈഡിൽ നിന്ന് തിരഞ്ഞെടുത്ത് നീക്കം ചെയ്യാൻ കഴിയണം. റെസിനിൽ അല്ലെങ്കിൽ വിച്ഛേദിച്ചതിന് ശേഷം.മൂന്നാമത്തെ തരം സൈഡ്-ചെയിൻ - സൈഡ് ചെയിൻ സൈക്ലൈസേഷൻ എന്നത് ടൈറോസിൻ അല്ലെങ്കിൽ പി-ഹൈഡ്രോക്സിഫെനൈൽഗ്ലൈസിൻ വഴി ഡിഫെനൈൽ ഈഥറുകളുടെ രൂപവത്കരണമാണ്.പ്രകൃതിദത്ത ഉൽപന്നങ്ങളിൽ ഇത്തരത്തിലുള്ള സൈക്ലൈസേഷൻ സൂക്ഷ്മജീവ ഉൽപ്പന്നങ്ങളിൽ മാത്രമേ കാണപ്പെടുന്നുള്ളൂ, സൈക്ലൈസേഷൻ ഉൽപ്പന്നങ്ങൾക്ക് പലപ്പോഴും ഔഷധമൂല്യം ഉണ്ടാകും.ഈ സംയുക്തങ്ങൾ തയ്യാറാക്കുന്നതിന് അദ്വിതീയ പ്രതികരണ വ്യവസ്ഥകൾ ആവശ്യമാണ്, അതിനാൽ അവ പലപ്പോഴും പരമ്പരാഗത പെപ്റ്റൈഡുകളുടെ സമന്വയത്തിൽ ഉപയോഗിക്കാറില്ല.
(2) ടെർമിനൽ-ടു-സൈഡ്ചെയിൻ
ടെർമിനൽ-സൈഡ് ചെയിൻ സൈക്ലൈസേഷനിൽ സാധാരണയായി സി-ടെർമിനൽ ലൈസിൻ അല്ലെങ്കിൽ ഓർനിഥൈൻ സൈഡ് ചെയിനിന്റെ അമിനോ ഗ്രൂപ്പും അല്ലെങ്കിൽ അസ്പാർട്ടിക് ആസിഡ് അല്ലെങ്കിൽ ഗ്ലൂട്ടാമിക് ആസിഡ് സൈഡ് ചെയിൻ ഉള്ള എൻ-ടെർമിനലും ഉൾപ്പെടുന്നു.ടെർമിനൽ സിക്കും സെറിൻ അല്ലെങ്കിൽ ത്രിയോണിൻ സൈഡ് ചെയിനുകൾക്കും ഇടയിൽ ഈതർ ബോണ്ടുകൾ രൂപപ്പെടുത്തിയാണ് മറ്റ് പോളിപെപ്റ്റൈഡ് സൈക്ലൈസേഷൻ നിർമ്മിക്കുന്നത്.
(3) ടെർമിനൽ അല്ലെങ്കിൽ ഹെഡ്-ടു-ടെയിൽ തരം
ചെയിൻ പോളിപെപ്റ്റൈഡുകൾ ഒരു ലായകത്തിൽ സൈക്കിൾ ചെയ്യാവുന്നതാണ് അല്ലെങ്കിൽ സൈഡ് ചെയിൻ സൈക്ലേഷൻ വഴി ഒരു റെസിനിൽ ഉറപ്പിക്കാം.പെപ്റ്റൈഡുകളുടെ ഒലിഗോമറൈസേഷൻ ഒഴിവാക്കാൻ ലായക കേന്ദ്രീകരണത്തിൽ പെപ്റ്റൈഡുകളുടെ കുറഞ്ഞ സാന്ദ്രത ഉപയോഗിക്കണം.ഒരു ഹെഡ്-ടു-ടെയിൽ സിന്തറ്റിക് റിംഗ് പോളിപെപ്റ്റൈഡിന്റെ വിളവ് ചെയിൻ പോളിപെപ്റ്റൈഡിന്റെ ക്രമത്തെ ആശ്രയിച്ചിരിക്കുന്നു.അതിനാൽ, വലിയ തോതിൽ സൈക്ലിക് പെപ്റ്റൈഡുകൾ തയ്യാറാക്കുന്നതിന് മുമ്പ്, സാധ്യമായ ചങ്ങലയുള്ള ലെഡ് പെപ്റ്റൈഡുകളുടെ ഒരു ലൈബ്രറി ആദ്യം സൃഷ്ടിക്കണം, തുടർന്ന് സൈക്ലൈസേഷൻ മികച്ച ഫലങ്ങളുള്ള ക്രമം കണ്ടെത്തണം.
2. എൻ-മെത്തിലേഷൻ
N-methylation യഥാർത്ഥത്തിൽ പ്രകൃതിദത്ത പെപ്റ്റൈഡുകളിലാണ് സംഭവിക്കുന്നത്, ഹൈഡ്രജൻ ബോണ്ടുകളുടെ രൂപീകരണം തടയുന്നതിനായി പെപ്റ്റൈഡ് സിന്തസിസിൽ അവതരിപ്പിക്കപ്പെടുന്നു, അതുവഴി പെപ്റ്റൈഡുകളെ ബയോഡീഗ്രേഡേഷനും ക്ലിയറൻസും കൂടുതൽ പ്രതിരോധിക്കും.N-methylated അമിനോ ആസിഡ് ഡെറിവേറ്റീവുകൾ ഉപയോഗിച്ച് പെപ്റ്റൈഡുകളുടെ സമന്വയമാണ് ഏറ്റവും പ്രധാനപ്പെട്ട രീതി.കൂടാതെ, മെഥനോളിനൊപ്പം N-(2-നൈട്രോബെൻസീൻ സൾഫോണിൽ ക്ലോറൈഡ്) പോളിപെപ്റ്റൈഡ്-റെസിൻ ഇന്റർമീഡിയറ്റുകളുടെ മിത്സുനോബു പ്രതികരണവും ഉപയോഗിക്കാം.എൻ-മെഥൈലേറ്റഡ് അമിനോ ആസിഡുകൾ അടങ്ങിയ സൈക്ലിക് പെപ്റ്റൈഡ് ലൈബ്രറികൾ തയ്യാറാക്കാൻ ഈ രീതി ഉപയോഗിക്കുന്നു.
3. ഫോസ്ഫോറിലേഷൻ
വിവർത്തനത്തിനു ശേഷമുള്ള പ്രകൃതിയിലെ ഏറ്റവും സാധാരണമായ പരിഷ്കാരങ്ങളിൽ ഒന്നാണ് ഫോസ്ഫോറിലേഷൻ.മനുഷ്യ കോശങ്ങളിൽ, 30% പ്രോട്ടീനുകൾ ഫോസ്ഫോറിലേറ്റഡ് ആണ്.സിഗ്നൽ ട്രാൻസ്ഡക്ഷൻ, ജീൻ എക്സ്പ്രഷൻ, സെൽ സൈക്കിൾ, സൈറ്റോസ്കെലിറ്റൺ റെഗുലേഷൻ, അപ്പോപ്ടോസിസ് തുടങ്ങി നിരവധി സെല്ലുലാർ പ്രക്രിയകളെ നിയന്ത്രിക്കുന്നതിൽ ഫോസ്ഫോറിലേഷൻ, പ്രത്യേകിച്ച് റിവേഴ്സിബിൾ ഫോസ്ഫോറിലേഷൻ ഒരു പ്രധാന പങ്ക് വഹിക്കുന്നു.
വിവിധതരം അമിനോ ആസിഡ് അവശിഷ്ടങ്ങളിൽ ഫോസ്ഫോറിലേഷൻ നിരീക്ഷിക്കാവുന്നതാണ്, എന്നാൽ ഏറ്റവും സാധാരണമായ ഫോസ്ഫോറിലേഷൻ ലക്ഷ്യങ്ങൾ സെറിൻ, ത്രിയോണിൻ, ടൈറോസിൻ അവശിഷ്ടങ്ങളാണ്.ഫോസ്ഫോടൈറോസിൻ, ഫോസ്ഫോത്രിയോൺ, ഫോസ്ഫോസെറിൻ ഡെറിവേറ്റീവുകൾ എന്നിവ സിന്തസിസ് സമയത്ത് പെപ്റ്റൈഡുകളിലേക്ക് ചേർക്കാം അല്ലെങ്കിൽ പെപ്റ്റൈഡ് സിന്തസിസിന് ശേഷം രൂപം കൊള്ളാം.സെറിൻ, ത്രിയോണിൻ, ടൈറോസിൻ എന്നിവയുടെ അവശിഷ്ടങ്ങൾ ഉപയോഗിച്ച് സെലക്ടീവ് ഫോസ്ഫോറിലേഷൻ നേടാം, അത് സംരക്ഷിത ഗ്രൂപ്പുകളെ തിരഞ്ഞെടുത്ത് നീക്കം ചെയ്യുന്നു.ചില ഫോസ്ഫോറിലേഷൻ റിയാഗന്റുകൾക്ക് പോസ്ഫോറിക് ആസിഡ് ഗ്രൂപ്പുകളെ പോസ്റ്റ് മോഡിഫിക്കേഷൻ വഴി പോളിപെപ്റ്റൈഡിലേക്ക് അവതരിപ്പിക്കാനും കഴിയും.സമീപ വർഷങ്ങളിൽ, രാസപരമായി തിരഞ്ഞെടുത്ത സ്റ്റൗഡിംഗർ-ഫോസ്ഫൈറ്റ് പ്രതികരണം ഉപയോഗിച്ച് ലൈസിൻ സൈറ്റിന്റെ നിർദ്ദിഷ്ട ഫോസ്ഫോറിലേഷൻ നേടിയിട്ടുണ്ട് (ചിത്രം 3).
4. മൈറിസ്റ്റൈലേഷനും പാൽമിറ്റോയിലേഷനും
ഫാറ്റി ആസിഡുകളുള്ള എൻ-ടെർമിനലിന്റെ അസൈലേഷൻ പെപ്റ്റൈഡുകളോ പ്രോട്ടീനുകളോ കോശ സ്തരങ്ങളുമായി ബന്ധിപ്പിക്കാൻ അനുവദിക്കുന്നു.എൻ-ടെർമിനലിലെ മിറിഡമോയ്ലേറ്റഡ് സീക്വൻസ് എസ്ആർസി ഫാമിലി പ്രോട്ടീൻ കൈനസുകളും റിവേഴ്സ് ട്രാൻസ്ക്രിപ്റ്റേസ് ഗാക്ക് പ്രോട്ടീനുകളും കോശ സ്തരങ്ങളുമായി ബന്ധിപ്പിക്കാൻ ലക്ഷ്യമിടുന്നു.സ്റ്റാൻഡേർഡ് കപ്ലിംഗ് പ്രതികരണങ്ങൾ ഉപയോഗിച്ച് മിറിസ്റ്റിക് ആസിഡ് റെസിൻ-പോളിപെപ്റ്റൈഡിന്റെ എൻ-ടെർമിനലുമായി ബന്ധിപ്പിച്ചിരിക്കുന്നു, തത്ഫലമായുണ്ടാകുന്ന ലിപ്പോപെപ്റ്റൈഡ് സാധാരണ അവസ്ഥയിൽ വിഘടിപ്പിക്കുകയും ആർപി-എച്ച്പിഎൽസി വഴി ശുദ്ധീകരിക്കുകയും ചെയ്യാം.
5. ഗ്ലൈക്കോസൈലേഷൻ
വാൻകോമൈസിൻ, ടീക്കോലാനിൻ തുടങ്ങിയ ഗ്ലൈക്കോപെപ്റ്റൈഡുകൾ മയക്കുമരുന്ന് പ്രതിരോധശേഷിയുള്ള ബാക്ടീരിയ അണുബാധകളുടെ ചികിത്സയ്ക്കുള്ള പ്രധാന ആൻറിബയോട്ടിക്കുകളാണ്, കൂടാതെ മറ്റ് ഗ്ലൈക്കോപെപ്റ്റൈഡുകൾ രോഗപ്രതിരോധ സംവിധാനത്തെ ഉത്തേജിപ്പിക്കാൻ പലപ്പോഴും ഉപയോഗിക്കുന്നു.കൂടാതെ, പല മൈക്രോബയൽ ആന്റിജനുകളും ഗ്ലൈക്കോസൈലേറ്റഡ് ആയതിനാൽ, അണുബാധയുടെ ചികിത്സാ പ്രഭാവം മെച്ചപ്പെടുത്തുന്നതിന് ഗ്ലൈക്കോപെപ്റ്റൈഡുകൾ പഠിക്കുന്നത് വളരെ പ്രധാനമാണ്.മറുവശത്ത്, ട്യൂമർ കോശങ്ങളുടെ കോശ സ്തരത്തിലെ പ്രോട്ടീനുകൾ അസാധാരണമായ ഗ്ലൈക്കോസൈലേഷൻ പ്രകടിപ്പിക്കുന്നതായി കണ്ടെത്തി, ഇത് ക്യാൻസറിലും ട്യൂമർ രോഗപ്രതിരോധ ഗവേഷണത്തിലും ഗ്ലൈക്കോപെപ്റ്റൈഡുകൾ ഒരു പ്രധാന പങ്ക് വഹിക്കുന്നു.Glycopeptides തയ്യാറാക്കുന്നത് Fmoc/t-Bu രീതിയാണ്.ഗ്ലൈക്കോസൈലേറ്റഡ് അമിനോ ആസിഡുകളെ സംരക്ഷിക്കുന്നതിനായി പെന്റാഫ്ലൂറോഫെനോൾ ഈസ്റ്റർ ആക്ടിവേറ്റഡ് എഫ്എംഒസികൾ വഴി ത്രിയോണിൻ, സെറിൻ തുടങ്ങിയ ഗ്ലൈക്കോസൈലേറ്റഡ് അവശിഷ്ടങ്ങൾ പലപ്പോഴും പോളിപെപ്റ്റൈഡുകളിലേക്ക് അവതരിപ്പിക്കുന്നു.
6. ഐസോപ്രീൻ
സി-ടെർമിനലിനടുത്തുള്ള സൈഡ് ചെയിനിലെ സിസ്റ്റൈൻ അവശിഷ്ടങ്ങളിൽ ഐസോപെന്റഡൈനൈലേഷൻ സംഭവിക്കുന്നു.പ്രോട്ടീൻ ഐസോപ്രീന് കോശ സ്തര ബന്ധം മെച്ചപ്പെടുത്താനും പ്രോട്ടീൻ-പ്രോട്ടീൻ ഇടപെടൽ രൂപപ്പെടുത്താനും കഴിയും.ടൈറോസിൻ ഫോസ്ഫേറ്റേസ്, ചെറിയ ജിറ്റേസ്, കോച്ചപെറോൺ തന്മാത്രകൾ, ന്യൂക്ലിയർ ലാമിന, സെൻട്രോമെറിക് ബൈൻഡിംഗ് പ്രോട്ടീനുകൾ എന്നിവ ഐസോപെന്റഡൈനേറ്റഡ് പ്രോട്ടീനുകളിൽ ഉൾപ്പെടുന്നു.റെസിനുകളിൽ ഐസോപ്രീൻ ഉപയോഗിച്ചോ സിസ്റ്റൈൻ ഡെറിവേറ്റീവുകൾ അവതരിപ്പിച്ചോ ഐസോപ്രീൻ പോളിപെപ്റ്റൈഡുകൾ തയ്യാറാക്കാം.
7. പോളിയെത്തിലീൻ ഗ്ലൈക്കോൾ (PEG) പരിഷ്ക്കരണം
പ്രോട്ടീൻ ഹൈഡ്രോലൈറ്റിക് സ്ഥിരത, ബയോഡിസ്ട്രിബ്യൂഷൻ, പെപ്റ്റൈഡ് സോളബിലിറ്റി എന്നിവ മെച്ചപ്പെടുത്താൻ PEG പരിഷ്ക്കരണം ഉപയോഗിക്കാം.പെപ്റ്റൈഡുകളിലേക്ക് PEG ശൃംഖലകൾ അവതരിപ്പിക്കുന്നത് അവയുടെ ഔഷധഗുണങ്ങൾ മെച്ചപ്പെടുത്തുകയും പ്രോട്ടിയോലൈറ്റിക് എൻസൈമുകൾ വഴി പെപ്റ്റൈഡുകളുടെ ജലവിശ്ലേഷണത്തെ തടയുകയും ചെയ്യും.പിഇജി പെപ്റ്റൈഡുകൾ സാധാരണ പെപ്റ്റൈഡുകളേക്കാൾ എളുപ്പത്തിൽ ഗ്ലോമെറുലാർ കാപ്പിലറി ക്രോസ് സെക്ഷനിലൂടെ കടന്നുപോകുന്നു, ഇത് വൃക്കസംബന്ധമായ ക്ലിയറൻസ് ഗണ്യമായി കുറയ്ക്കുന്നു.വിവോയിലെ PEG പെപ്റ്റൈഡുകളുടെ സജീവമായ അർദ്ധായുസ്സ് കാരണം, കുറഞ്ഞ ഡോസുകളും കുറഞ്ഞ തവണ പെപ്റ്റൈഡ് മരുന്നുകളും ഉപയോഗിച്ച് സാധാരണ ചികിത്സാ നില നിലനിർത്താൻ കഴിയും.എന്നിരുന്നാലും, PEG പരിഷ്ക്കരണത്തിന് നെഗറ്റീവ് ഇഫക്റ്റുകളും ഉണ്ട്.വലിയ അളവിലുള്ള PEG എൻസൈമിനെ പെപ്റ്റൈഡിനെ നശിപ്പിക്കുന്നതിൽ നിന്ന് തടയുകയും ടാർഗെറ്റ് റിസപ്റ്ററുമായി പെപ്റ്റൈഡിന്റെ ബന്ധനം കുറയ്ക്കുകയും ചെയ്യുന്നു.എന്നാൽ PEG പെപ്റ്റൈഡുകളുടെ കുറഞ്ഞ അഫിനിറ്റി സാധാരണയായി അവയുടെ ദൈർഘ്യമേറിയ ഫാർമക്കോകൈനറ്റിക് അർദ്ധായുസ്സിനാൽ ഓഫ്സെറ്റ് ചെയ്യപ്പെടുന്നു, കൂടാതെ ശരീരത്തിൽ കൂടുതൽ കാലം നിലനിൽക്കുന്നതിലൂടെ, PEG പെപ്റ്റൈഡുകൾ ടാർഗെറ്റ് ടിഷ്യൂകളിലേക്ക് ആഗിരണം ചെയ്യപ്പെടാനുള്ള സാധ്യത കൂടുതലാണ്.അതിനാൽ, ഒപ്റ്റിമൽ ഫലങ്ങൾക്കായി PEG പോളിമർ സ്പെസിഫിക്കേഷനുകൾ ഒപ്റ്റിമൈസ് ചെയ്യണം.മറുവശത്ത്, വൃക്കസംബന്ധമായ ക്ലിയറൻസ് കുറയുന്നതിനാൽ PEG പെപ്റ്റൈഡുകൾ കരളിൽ അടിഞ്ഞുകൂടുന്നു, ഇത് മാക്രോമോളികുലാർ സിൻഡ്രോമിന് കാരണമാകുന്നു.അതിനാൽ, മയക്കുമരുന്ന് പരിശോധനയ്ക്കായി പെപ്റ്റൈഡുകൾ ഉപയോഗിക്കുമ്പോൾ PEG പരിഷ്കാരങ്ങൾ കൂടുതൽ ശ്രദ്ധയോടെ രൂപകൽപ്പന ചെയ്യേണ്ടതുണ്ട്.
PEG മോഡിഫയറുകളുടെ പൊതുവായ പരിഷ്ക്കരണ ഗ്രൂപ്പുകളെ ഇനിപ്പറയുന്ന രീതിയിൽ സംഗ്രഹിക്കാം: അമിനോ (-അമിൻ) -NH2, അമിനോമെതൈൽ-Ch2-NH2, ഹൈഡ്രോക്സി-OH, കാർബോക്സി-കൂഹ്, സൾഫൈഡ്രൈൽ (-തിയോൾ) -SH, Maleimide -MAL, succinimide കാർബണേറ്റ് - SC, succinimide അസറ്റേറ്റ് -SCM, succinimide പ്രൊപിയോണേറ്റ് -SPA, n-ഹൈഡ്രോക്സിസുസിനിമൈഡ് -NHS, Acrylate-ch2ch2cooh, aldehyde -CHO (പ്രൊപിയോണൽ-ആൽഡ്, ബ്യൂട്ടൈറാൽഡ് പോലുള്ളവ), അക്രിലിക് ബേസ് (-acrylate-acrl) Biotin, Fluorescein, glutaryl -GA, Acrylate Hydrazide, alkyne-alkyne, p-toluenesulfonate -OTs, succinimide succinate -SS മുതലായവ. കാർബോക്സിലിക് ആസിഡുകളുള്ള PEG ഡെറിവേറ്റീവുകൾ n-ടെർമിനൽ അമൈനുകളുമായോ ലൈസിൻ ചെയിനുകളുമായോ യോജിപ്പിക്കാം.അമിനോ-ആക്ടിവേറ്റഡ് PEG അസ്പാർട്ടിക് ആസിഡ് അല്ലെങ്കിൽ ഗ്ലൂട്ടാമിക് ആസിഡ് സൈഡ് ചെയിനുകളുമായി ബന്ധിപ്പിക്കാവുന്നതാണ്.മാൽ-ആക്ടിവേറ്റഡ് PEG, പൂർണ്ണമായും നീക്കം ചെയ്യപ്പെട്ട സിസ്റ്റൈൻ സൈഡ് ചെയിനുകളുടെ മെർക്യാപ്റ്റനുമായി സംയോജിപ്പിക്കാം [11].PEG മോഡിഫയറുകൾ സാധാരണയായി ഇനിപ്പറയുന്ന രീതിയിൽ തരംതിരിച്ചിട്ടുണ്ട് (ശ്രദ്ധിക്കുക: mPEG എന്നത് methoxy-PEG ആണ്, CH3O-(CH2CH2O)n-CH2CH2-OH) :
(1) നേരായ ചെയിൻ PEG മോഡിഫയർ
mPEG-SC, mPEG-SCM, mPEG-SPA, mPEG-OTs, mPEG-SH, mPEG-ALD, mPEG-butyrALD, mPEG-SS
(2) ബൈഫങ്ഷണൽ PEG മോഡിഫയർ
HCOO-PEG-COOH, NH2-PEG-NH2, OH-PEG-COOH, OH-PEG-NH2, HCl·NH2-PEG-COOH, MAL-PEG-NHS
(3) ബ്രാഞ്ചിംഗ് PEG മോഡിഫയർ
(mPEG)2-NHS, (mPEG)2-ALD, (mPEG)2-NH2, (mPEG)2-MAL
8. ബയോട്ടിനൈസേഷൻ
ബയോട്ടിൻ അവിഡിൻ അല്ലെങ്കിൽ സ്ട്രെപ്റ്റാവിഡിൻ എന്നിവയുമായി ശക്തമായി ബന്ധിപ്പിച്ചേക്കാം, ബൈൻഡിംഗ് ശക്തി കോവാലന്റ് ബോണ്ടിനോട് അടുത്താണ്.ബയോട്ടിൻ-ലേബൽ ചെയ്ത പെപ്റ്റൈഡുകൾ സാധാരണയായി രോഗപ്രതിരോധ പരിശോധന, ഹിസ്റ്റോസൈറ്റോകെമിസ്ട്രി, ഫ്ലൂറസെൻസ് അടിസ്ഥാനമാക്കിയുള്ള ഫ്ലോ സൈറ്റോമെട്രി എന്നിവയിൽ ഉപയോഗിക്കുന്നു.ബയോട്ടിനൈലേറ്റഡ് പെപ്റ്റൈഡുകളെ ബന്ധിപ്പിക്കുന്നതിന് ലേബൽ ചെയ്ത ആന്റിബയോട്ടിൻ ആന്റിബോഡികളും ഉപയോഗിക്കാം.ബയോട്ടിൻ ലേബലുകൾ പലപ്പോഴും ലൈസിൻ സൈഡ് ചെയിനിലോ N ടെർമിനലിലോ ഘടിപ്പിച്ചിരിക്കുന്നു.6-അമിനോകാപ്രോയിക് ആസിഡ് പലപ്പോഴും പെപ്റ്റൈഡുകളും ബയോട്ടിനും തമ്മിലുള്ള ഒരു ബോണ്ടായി ഉപയോഗിക്കുന്നു.അടിവസ്ത്രവുമായി ബന്ധിപ്പിക്കുന്നതിൽ ബോണ്ട് വഴക്കമുള്ളതും സ്റ്റെറിക് തടസ്സത്തിന്റെ സാന്നിധ്യത്തിൽ നന്നായി ബന്ധിപ്പിക്കുന്നതുമാണ്.
9. ഫ്ലൂറസന്റ് ലേബലിംഗ്
ജീവനുള്ള കോശങ്ങളിലെ പോളിപെപ്റ്റൈഡുകൾ കണ്ടെത്താനും എൻസൈമുകളും പ്രവർത്തനരീതികളും പഠിക്കാനും ഫ്ലൂറസെന്റ് ലേബലിംഗ് ഉപയോഗിക്കാം.ട്രിപ്റ്റോഫാൻ (Trp) ഫ്ലൂറസന്റ് ആണ്, അതിനാൽ ഇത് ആന്തരിക ലേബലിംഗിനായി ഉപയോഗിക്കാം.ട്രിപ്റ്റോഫാന്റെ എമിഷൻ സ്പെക്ട്രം പെരിഫറൽ പരിതസ്ഥിതിയെ ആശ്രയിച്ചിരിക്കുന്നു, ലായക ധ്രുവീകരണം കുറയുന്നതിനനുസരിച്ച് കുറയുന്നു, പെപ്റ്റൈഡ് ഘടനയും റിസപ്റ്റർ ബൈൻഡിംഗും കണ്ടെത്തുന്നതിന് ഇത് ഉപയോഗപ്രദമാണ്.ട്രിപ്റ്റോഫാൻ ഫ്ലൂറസെൻസിനെ പ്രോട്ടൊണേറ്റഡ് അസ്പാർട്ടിക് ആസിഡും ഗ്ലൂട്ടാമിക് ആസിഡും ഉപയോഗിച്ച് ശമിപ്പിക്കാൻ കഴിയും, ഇത് അതിന്റെ ഉപയോഗം പരിമിതപ്പെടുത്തിയേക്കാം.ഡാൻസിൽ ക്ലോറൈഡ് ഗ്രൂപ്പ് (ഡാൻസിൽ) ഒരു അമിനോ ഗ്രൂപ്പുമായി ബന്ധിക്കുമ്പോൾ ഉയർന്ന ഫ്ലൂറസന്റ് ആണ്, ഇത് പലപ്പോഴും അമിനോ ആസിഡുകൾക്കോ പ്രോട്ടീനുകൾക്കോ ഒരു ഫ്ലൂറസെന്റ് ലേബലായി ഉപയോഗിക്കുന്നു.
ഫ്ലൂറസെൻസ് റിസോണൻസ് എനർജി കൺവേർഷൻ (FRET) എൻസൈം പഠനത്തിന് ഉപയോഗപ്രദമാണ്.FRET പ്രയോഗിക്കുമ്പോൾ, സബ്സ്ട്രേറ്റ് പോളിപെപ്റ്റൈഡിൽ സാധാരണയായി ഒരു ഫ്ലൂറസെൻസ്-ലേബലിംഗ് ഗ്രൂപ്പും ഒരു ഫ്ലൂറസെൻസ്-ക്വെഞ്ചിംഗ് ഗ്രൂപ്പും അടങ്ങിയിരിക്കുന്നു.ലേബൽ ചെയ്ത ഫ്ലൂറസെന്റ് ഗ്രൂപ്പുകളെ ഫോട്ടോൺ ഇതര ഊർജ്ജ കൈമാറ്റം വഴി ശമിപ്പിക്കുന്നു.സംശയാസ്പദമായ എൻസൈമിൽ നിന്ന് പെപ്റ്റൈഡ് വേർപെടുത്തുമ്പോൾ, ലേബലിംഗ് ഗ്രൂപ്പ് ഫ്ലൂറസെൻസ് പുറപ്പെടുവിക്കുന്നു.
10. കേജ് പോളിപെപ്റ്റൈഡുകൾ
കേജ് പെപ്റ്റൈഡുകൾക്ക് ഒപ്റ്റിക്കലി നീക്കം ചെയ്യാവുന്ന സംരക്ഷണ ഗ്രൂപ്പുകളുണ്ട്, അത് പെപ്റ്റൈഡിനെ റിസപ്റ്ററുമായി ബന്ധിപ്പിക്കുന്നതിൽ നിന്ന് സംരക്ഷിക്കുന്നു.അൾട്രാവയലറ്റ് വികിരണത്തിന് വിധേയമാകുമ്പോൾ, പെപ്റ്റൈഡ് സജീവമാവുകയും റിസപ്റ്ററുമായുള്ള ബന്ധം പുനഃസ്ഥാപിക്കുകയും ചെയ്യുന്നു.ഈ ഒപ്റ്റിക്കൽ ആക്ടിവേഷൻ സമയം, ആംപ്ലിറ്റ്യൂഡ് അല്ലെങ്കിൽ സ്ഥാനം അനുസരിച്ച് നിയന്ത്രിക്കാൻ കഴിയുന്നതിനാൽ, കോശങ്ങളിൽ സംഭവിക്കുന്ന പ്രതിപ്രവർത്തനങ്ങൾ പഠിക്കാൻ കേജ് പെപ്റ്റൈഡുകൾ ഉപയോഗിക്കാം.കേജ് പോളിപെപ്റ്റൈഡുകൾക്കായി ഏറ്റവും സാധാരണയായി ഉപയോഗിക്കുന്ന സംരക്ഷിത ഗ്രൂപ്പുകൾ 2-നൈട്രോബെൻസിൽ ഗ്രൂപ്പുകളും അവയുടെ ഡെറിവേറ്റീവുകളുമാണ്, അവ സംരക്ഷിത അമിനോ ആസിഡ് ഡെറിവേറ്റീവുകൾ വഴി പെപ്റ്റൈഡ് സിന്തസിസിൽ അവതരിപ്പിക്കാം.വികസിപ്പിച്ചെടുത്ത അമിനോ ആസിഡ് ഡെറിവേറ്റീവുകൾ ലൈസിൻ, സിസ്റ്റൈൻ, സെറിൻ, ടൈറോസിൻ എന്നിവയാണ്.എന്നിരുന്നാലും, അസ്പാർട്ടേറ്റ്, ഗ്ലൂട്ടാമേറ്റ് ഡെറിവേറ്റീവുകൾ പെപ്റ്റൈഡ് സിന്തസിസിലും ഡിസോസിയേഷനിലും സൈക്ലൈസേഷനുള്ള സാധ്യത കാരണം സാധാരണയായി ഉപയോഗിക്കാറില്ല.
11. പോളിയാന്റിജെനിക് പെപ്റ്റൈഡ് (MAP)
ഷോർട്ട് പെപ്റ്റൈഡുകൾ സാധാരണയായി പ്രതിരോധശേഷിയുള്ളവയല്ല, ആന്റിബോഡികൾ ഉൽപ്പാദിപ്പിക്കുന്നതിന് കാരിയർ പ്രോട്ടീനുകളുമായി ബന്ധിപ്പിക്കേണ്ടതുണ്ട്.പോളിയാന്റിജെനിക് പെപ്റ്റൈഡ് (MAP) ലൈസിൻ ന്യൂക്ലിയസുമായി ബന്ധിപ്പിച്ചിരിക്കുന്ന ഒന്നിലധികം പെപ്റ്റൈഡുകൾ അടങ്ങിയതാണ്, അവയ്ക്ക് ഉയർന്ന ശക്തിയുള്ള ഇമ്മ്യൂണോജനുകൾ പ്രത്യേകമായി പ്രകടിപ്പിക്കാനും പെപ്റ്റൈഡ്-കാരിയർ പ്രോട്ടീൻ കപ്പിൾറ്റുകൾ തയ്യാറാക്കാൻ ഉപയോഗിക്കാനും കഴിയും.MAP റെസിനിലെ സോളിഡ് ഫേസ് സിന്തസിസ് വഴി MAP പോളിപെപ്റ്റൈഡുകൾ സമന്വയിപ്പിക്കാൻ കഴിയും.എന്നിരുന്നാലും, അപൂർണ്ണമായ കപ്ലിംഗ് ചില ശാഖകളിൽ പെപ്റ്റൈഡ് ശൃംഖല നഷ്ടപ്പെടുകയോ വെട്ടിച്ചുരുക്കുകയോ ചെയ്യുന്നു, അതിനാൽ യഥാർത്ഥ MAP പോളിപെപ്റ്റൈഡിന്റെ ഗുണവിശേഷതകൾ പ്രകടിപ്പിക്കുന്നില്ല.ഒരു ബദലായി, പെപ്റ്റൈഡുകൾ പ്രത്യേകം തയ്യാറാക്കുകയും ശുദ്ധീകരിക്കുകയും തുടർന്ന് MAP-യുമായി ബന്ധിപ്പിക്കുകയും ചെയ്യാം.പെപ്റ്റൈഡ് കാമ്പിൽ ഘടിപ്പിച്ചിരിക്കുന്ന പെപ്റ്റൈഡ് സീക്വൻസ് നന്നായി നിർവചിക്കപ്പെട്ടതും മാസ്സ് സ്പെക്ട്രോമെട്രിയുടെ സവിശേഷതയുമാണ്.
ഉപസംഹാരം
പെപ്റ്റൈഡുകൾ രൂപകല്പന ചെയ്യുന്നതിനുള്ള ഒരു പ്രധാന മാർഗമാണ് പെപ്റ്റൈഡ് പരിഷ്ക്കരണം.രാസപരമായി പരിഷ്കരിച്ച പെപ്റ്റൈഡുകൾക്ക് ഉയർന്ന ജൈവിക പ്രവർത്തനം നിലനിർത്താൻ മാത്രമല്ല, പ്രതിരോധശേഷി, വിഷാംശം എന്നിവയുടെ പോരായ്മകൾ ഫലപ്രദമായി ഒഴിവാക്കാനും കഴിയും.അതേസമയം, കെമിക്കൽ പരിഷ്ക്കരണത്തിന് പെപ്റ്റൈഡുകൾക്ക് ചില പുതിയ മികച്ച ഗുണങ്ങൾ നൽകാനാകും.സമീപ വർഷങ്ങളിൽ, പോളിപെപ്റ്റൈഡുകളുടെ പോസ്റ്റ്-മോഡിഫിക്കേഷനായി CH സജീവമാക്കൽ രീതി അതിവേഗം വികസിപ്പിച്ചെടുത്തിട്ടുണ്ട്, കൂടാതെ നിരവധി പ്രധാന ഫലങ്ങൾ കൈവരിച്ചിട്ടുണ്ട്.
പോസ്റ്റ് സമയം: മാർച്ച്-20-2023