കോശങ്ങൾ തുളച്ചുകയറുന്ന പെപ്റ്റൈഡുകൾ എന്തൊക്കെയാണ്?

സെൽ മെംബ്രണിലേക്ക് എളുപ്പത്തിൽ തുളച്ചുകയറാൻ കഴിയുന്ന ചെറിയ പെപ്റ്റൈഡുകളാണ് സെൽ-പെനെട്രേറ്റിംഗ് പെപ്റ്റൈഡുകൾ.ഈ തരം തന്മാത്രകൾ, പ്രത്യേകിച്ച് ടാർഗെറ്റിംഗ് ഫംഗ്‌ഷനുകളുള്ള സിപിപികൾ, ടാർഗെറ്റ് സെല്ലുകളിലേക്ക് കാര്യക്ഷമമായ മയക്കുമരുന്ന് ഡെലിവറിക്ക് വാഗ്ദാനം ചെയ്യുന്നു.

അതിനാൽ, ഇതിനെക്കുറിച്ചുള്ള ഗവേഷണത്തിന് ചില ബയോമെഡിക്കൽ പ്രാധാന്യമുണ്ട്.ഈ പഠനത്തിൽ, വ്യത്യസ്ത ട്രാൻസ്മെംബ്രെൻ പ്രവർത്തനങ്ങളുള്ള സിപിപികൾ സീക്വൻസ് തലത്തിൽ പഠിച്ചു, സിപിപികളുടെ ട്രാൻസ്മെംബ്രെൻ പ്രവർത്തനത്തെ ബാധിക്കുന്ന ഘടകങ്ങൾ, വ്യത്യസ്ത പ്രവർത്തനങ്ങളുള്ള സിപിപികളും നോൺസിപിപികളും തമ്മിലുള്ള ക്രമ വ്യത്യാസങ്ങൾ എന്നിവ കണ്ടെത്താനും ബയോളജിക്കൽ സീക്വൻസുകൾ വിശകലനം ചെയ്യുന്നതിനുള്ള ഒരു രീതി അവതരിപ്പിക്കാനും ശ്രമിക്കുന്നു.

സി‌പി‌പി‌സൈറ്റ് ഡാറ്റാബേസിൽ നിന്നും വ്യത്യസ്ത ലിറ്ററേച്ചറുകളിൽ നിന്നും സി‌പി‌പികളും നോൺ‌സി‌പി‌പികളും സീക്വൻസുകൾ‌ ലഭിച്ചു, കൂടാതെ ഡാറ്റാ സെറ്റുകൾ‌ നിർമ്മിക്കുന്നതിന് സി‌പി‌പി സീക്വൻസുകളിൽ നിന്ന് ഉയർന്നതും ഇടത്തരവും കുറഞ്ഞതുമായ ട്രാൻസ്‌മെംബ്രേൻ പ്രവർത്തനങ്ങളുള്ള ട്രാൻസ്‌മെംബ്രേൻ പെപ്റ്റൈഡുകൾ (എച്ച്‌സി‌പി‌പികൾ, എം‌സി‌പി‌പികൾ, എൽ‌സി‌പി‌പികൾ) വേർതിരിച്ചെടുത്തു.ഈ ഡാറ്റാ സെറ്റുകളെ അടിസ്ഥാനമാക്കി, ഇനിപ്പറയുന്ന പഠനങ്ങൾ നടത്തി:

1, വിവിധ സജീവ സിപിപികളുടെയും നോൺസിപിപികളുടെയും അമിനോ ആസിഡും ദ്വിതീയ ഘടന ഘടനയും ANOVA വിശകലനം ചെയ്തു.സിപിപികളുടെ ട്രാൻസ്‌മെംബ്രൺ പ്രവർത്തനത്തിൽ അമിനോ ആസിഡുകളുടെ ഇലക്‌ട്രോസ്റ്റാറ്റിക്, ഹൈഡ്രോഫോബിക് ഇടപെടലുകൾ ഒരു പ്രധാന പങ്ക് വഹിക്കുന്നുണ്ടെന്ന് കണ്ടെത്തി, കൂടാതെ ഹെലിക്കൽ ഘടനയും റാൻഡം കോയിലിംഗും സിപിപികളുടെ ട്രാൻസ്‌മെംബ്രൺ പ്രവർത്തനത്തെ ബാധിച്ചു.

2. വ്യത്യസ്ത പ്രവർത്തനങ്ങളുള്ള സിപിപികളുടെ ഭൗതികവും രാസപരവുമായ ഗുണങ്ങളും നീളവും ദ്വിമാന തലത്തിൽ പ്രദർശിപ്പിച്ചിരിക്കുന്നു.വ്യത്യസ്‌ത പ്രവർത്തനങ്ങളുള്ള സി‌പി‌പികളും നോൺ‌സി‌പി‌പികളും ചില പ്രത്യേക പ്രോപ്പർട്ടികൾക്ക് കീഴിൽ ക്ലസ്റ്റർ ചെയ്യാമെന്ന് കണ്ടെത്തി, കൂടാതെ എച്ച്‌സി‌പി‌പികൾ, എം‌സി‌പി‌പികൾ, എൽ‌സി‌പി‌പികൾ, നോൺ‌സി‌പി‌പികൾ എന്നിവ അവയുടെ വ്യത്യാസങ്ങൾ കാണിക്കുന്ന മൂന്ന് ക്ലസ്റ്ററുകളായി തിരിച്ചിരിക്കുന്നു;

3. ഈ പേപ്പറിൽ, ബയോളജിക്കൽ സീക്വൻസിൻറെ ഫിസിക്കൽ, കെമിക്കൽ സെന്റോയിഡ് എന്ന ആശയം അവതരിപ്പിക്കപ്പെടുന്നു, കൂടാതെ സീക്വൻസ് രചിക്കുന്ന അവശിഷ്ടങ്ങൾ കണികാ പോയിന്റുകളായി കണക്കാക്കുന്നു, കൂടാതെ ഈ ശ്രേണി ഗവേഷണത്തിനുള്ള ഒരു കണികാ സംവിധാനമായി സംഗ്രഹിച്ചിരിക്കുന്നു.വ്യത്യസ്ത പ്രവർത്തനങ്ങളുള്ള CPP-കളെ PCA രീതി ഉപയോഗിച്ച് 3D പ്ലെയിനിലേക്ക് പ്രൊജക്റ്റ് ചെയ്തുകൊണ്ട് CPP-കളുടെ വിശകലനത്തിന് ഈ രീതി പ്രയോഗിച്ചു, കൂടാതെ മിക്ക CPP-കളും ഒരുമിച്ച് ക്ലസ്റ്ററായിരിക്കുന്നതായും ചില LCPP-കൾ NonCPP-കൾക്കൊപ്പം ഒന്നിച്ച് ചേർന്നതായും കണ്ടെത്തി.

ഈ പഠനത്തിന് CPP-കളുടെ രൂപകല്പനയിലും വ്യത്യസ്ത പ്രവർത്തനങ്ങളുള്ള CPP-കളുടെ ക്രമങ്ങളിലെ വ്യത്യാസങ്ങൾ മനസ്സിലാക്കുന്നതിനും സ്വാധീനമുണ്ട്.കൂടാതെ, ഈ പേപ്പറിൽ അവതരിപ്പിച്ചിരിക്കുന്ന ബയോളജിക്കൽ സീക്വൻസുകളുടെ ഫിസിക്കൽ, കെമിക്കൽ സെൻട്രോയിഡിന്റെ വിശകലന രീതി മറ്റ് ജൈവ പ്രശ്നങ്ങളുടെ വിശകലനത്തിനും ഉപയോഗിക്കാം.അതേ സമയം, ചില ബയോളജിക്കൽ ക്ലാസിഫിക്കേഷൻ പ്രശ്നങ്ങൾക്ക് ഇൻപുട്ട് പാരാമീറ്ററുകളായി അവ ഉപയോഗിക്കാനും പാറ്റേൺ തിരിച്ചറിയുന്നതിൽ പങ്കുവഹിക്കാനും കഴിയും.